廣泛靶向代謝組學
技術簡介
廣泛靶向代謝組學(Widely targeted metabonomics)是一種整合了非靶向代謝組學“廣泛性”和靶向代謝組學“準確性”檢測技術優(yōu)點的新型代謝組檢測技術,屬于新一代代謝組檢測技術。項目實測結果可達一次性定性定量檢測800-1200種代謝物質。
技術原理
將目標化合物的質譜參數(shù)(RT、Q1、Q3)信息添加進廣靶數(shù)據(jù)庫中,構建一個包含數(shù)據(jù)庫中所有化合物信息的質譜方法。基于已構建數(shù)據(jù)庫及檢測方法,采用MRM掃描模式采集樣本代謝組數(shù)據(jù),獲得物質的定性及相對定量結果。
服務產品:
技術特點
通量高,數(shù)據(jù)庫大:廣靶數(shù)據(jù)庫收錄幾千種代謝物,含大量次生代謝物
分辨率、靈敏度高:檢測下限達pg級,可發(fā)現(xiàn)更多低豐度代謝物
定性定量準:AB 6500+三重四極桿定量;自建標品數(shù)據(jù)庫準確定性結果
覆蓋廣,注釋信息全面:覆蓋KEGG中90%以上pathway,通路及功能分析準確可靠
技術路線:
送樣建議:
(1)樣本量要求:
血清/血漿:200 μL/sample
尿液:1mL/sample
動物組織:200mg/sample
糞便/腸道內容:200mg/sample
植物組織:1-2g/sample
(2)生物學重復:
植物:建議8個以上,不低于6個
動物:建議12個以上,不低于8個
臨床樣品:建議100個以上,不低于30個
案例分析
廣泛靶向的代謝組學分析尸體分解對不同類型水體中代謝特征的影響[1]
研究背景
動物尸體在降解過程中會產生許多有毒有害的代謝物,對水安全構成潛在的生態(tài)風險,從而威脅人類健康。然而,動物尸體分解產生的代謝物尚不清楚。
研究目的
選擇了尸體分解最終階段(第19天)的樣本來研究代謝特征并以魚類為動物模型,通過廣泛靶向的代謝組學,揭示兩種水(黃河水和自來水)中水質、微生物和有害代謝物之間的關系。
研究結果
結果顯示氨基酸代謝組學、吲哚及其衍生物、吡啶和吡啶衍生物主要發(fā)生在尸體組中,表明這些代謝物是尸體分解的標志物。一些有害代謝物(如多胺、胺類、苯和取代衍生物)與尸體分解高度相關,這揭示了如何研究水中有害物質的新見解。這項工作表明,尸體分解通過產生各種有毒代謝物導致水質惡化,從而為暴露于水生環(huán)境中的動物尸體時的有毒代謝物提供了新的見解。
圖1 廣泛靶向代謝組學分析尸體分解產生有毒代謝物整體思路
參考文獻
[1] Zhou R, Yu Q, Li T, et al. Carcass decomposition influences the metabolic profiles and enriches noxious metabolites in different water types by widely targeted metabolomics[J]. Chemosphere, 2020, 269:129400.
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